В новом мире, оставшемся после Великой войны, изменилось все.
В тени огромного города Залем, висящего в небе, раскинулся мегаполис, где люди живут посреди тонн мусора, сброшенного сверху.
Здесь процветает преступность, здесь люди борются за существование, а биология и техника слились воедино.
Добро пожаловать в Айрон сити!
Алита просыпается в мире, который не знает, не помнит, как появилась на свет, не помнит, кто ее создатели.
Она - киборг, ее изувеченное тело нашел на свалке доктор Дайсон Идо.
Он хочет защитить ее от прошлого, но с помощью своего нового друга Хьюго она пытается раскрыть тайну своего происхождения.
Когда же на нее начинается охота, Алита выясняет, что обладает уникальными боевыми способностями, которые нужны могущественным властителям Айрон сити.
И теперь Алита должна спасти не только своих друзей и новую семью, но и мир, который уже стал ей родным.